Piattaforma di SEQUENZIAMENTO Sequenziamento NGS (Next Generation Sequencing)
Sequenziamento NGS (Next Generation Sequencing)
Il sequenziatore Illumina NextSeq 2000 è un sistema di sequenziamento high-throughput altamente flessibile e scalabile, progettato per applicazioni di media e alta capacità. Il servizio offerto consente la generazione di dati di elevata qualità e affidabilità, con una resa fino a 360 Gb per corsa, adattabile a diverse esigenze sperimentali.
La piattaforma supporta un’ampia gamma di applicazioni, tra cui sequenziamento dell’esoma, analisi di pannelli target, trascrittomica (RNA-seq), studi su singola cellula e tecniche emergenti come la spatialomics. La possibilità di scegliere tra diverse flow cell, caratterizzate da differenti livelli di capacità e throughput, consente di modulare l’analisi in base al progetto, rendendo la piattaforma adatta sia a studi di piccola scala sia a progetti complessi, con un’ottimizzazione di tempi e costi.
La piattaforma di sequenziamento NGS comprende
- Sequenziatore NextSeq 2000 (compatibile con chimica XLEAP-SBS)
- Connessione web per la configurazione delle run e archiviazione dei dati nel cloud BaseSpace dell’utente.
- protocolli standard per le principali applicazioni di sequenziamento e eventuale messa a punto di protocolli per specifiche esigenze
- sistemi hardware e software di acquisizione dei dati prodotti dallo strumento e valutazione delle metriche di qualità del sequenziamento
- reagenti e materiali di uso comune necessari per gli esperimenti di sequenziamento, compresi i reagenti per il funzionamento degli strumenti e il loro ciclo di pulizia e calibrazione
- piccola strumentazione da banco e materiale plastico monouso per il caricamento delle librerie nella flow-cell
- Micropipette (range variabile) e puntali sterili filtrati
- Microcentrifughe da banco
- Vortex mixer
- Termoblocchi e termociclatori (PCR)
- Sistemi per quantificazione (fluorimetro Qubit, spettrofotometro NanoDrop)
- Sistemi per analisi della qualità delle librerie (Bioanalyzer)
